Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FSCN1Q16658 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms