Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
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