Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPN13Q12923 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPN13Q12923 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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