Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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