Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
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