Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HECTD4Q9Y4D8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HECTD4Q9Y4D8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms