Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZRN3Q9UPQ7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms