Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms