Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms