Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP4Q9UKK3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP4Q9UKK3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms