Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms