Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPA4Q9UI42 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms