Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NPC1L1Q9UHC9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms