Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms