Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms