Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BSDC1Q9NW68 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BSDC1Q9NW68 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms