Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCAF13Q9NV06 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms