Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4BQ9NT99 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms