Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms