Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOMER2Q9NSB8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms