Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCC2Q9HCC0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCC2Q9HCC0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCC2Q9HCC0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCC2Q9HCC0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCC2Q9HCC0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCC2Q9HCC0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms