Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms