Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms