Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC8Q9BY41 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms