Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA3Q9BTC8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms