Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD5Q99666 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms