Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KC1Q96S38 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms