Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms