Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMTK3Q96Q04 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms