Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRERF1Q96PN7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRERF1Q96PN7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRERF1Q96PN7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRERF1Q96PN7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRERF1Q96PN7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRERF1Q96PN7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms