Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP3Q96P20 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms