Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF4Q96M43 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms