Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UBE2E2Q96LR5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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