Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC41A2Q96JW4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC41A2Q96JW4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms