Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms