Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG1Q8WVM7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms