Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGDCC4Q8TDY8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms