Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms