Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CHST4Q8NCG5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST4Q8NCG5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHST4Q8NCG5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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