Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms