Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC155Q8N6L0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC155Q8N6L0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms