Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
HERC6Q8IVU3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERC6Q8IVU3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms