Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms