Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX29Q7Z478 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX29Q7Z478 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX29Q7Z478 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX29Q7Z478 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX29Q7Z478 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX29Q7Z478 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX29Q7Z478 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX29Q7Z478 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms