Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT27Q7Z3Y8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms