Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms