Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms