Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms