Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L2Q6R6M4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms