Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms